Biyoloji, bilgisayar bilimi ve mühendislik Schällemätteli'de birleşiyor

Zürih Politeknik Üniversitesi Biyosistemler Bölümü, Basel'deki yerel Yaşam Bilimleri Kampüsü'nün yenilikçi BSS binasında hazır

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Zürih'teki Federal Teknoloji Enstitüsü'nün Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü içindeki yeni binası: D-BSSE'nin (Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü) beşgen şeklindeki yenilikçi genel merkezi, Biozentrum'a yakındır. Pharmazentrum, DBM'nin yanı sıra Çocuk Hastanesi ve Basel Üniversite Hastanesi'nde (Fotoğraf: Erich Meyer)

İsviçre'de ETH Zürih'in Basel'de Biyosistemler Departmanı kurma fikri uzun süre gerçekleştirilemez görünüyordu.

Bugün biyoloji, bilgisayar bilimi ve mühendislik arasındaki çizgilerin bulanıklaştığı ve araştırmacıların giderek daha fazla tıbbi uygulamalara odaklandığı yeni bir binada yerini buluyor.

Yeni BSS binasının ilk ziyaretçilerini etkileyici bir manzara bekliyor.

Resepsiyon alanının hemen ardından kendinizi şaşırtıcı derecede aydınlık ve havadar bir alana, ışıkla dolu ve şeffaf bir cam çatıyla kaplı etkileyici bir atriyuma kaptırırsınız.

Bu devasa girişin sonunda sarmal bir merdiven üst katlara çıkıyor.

Buradaki izlenim sonsuz sayıda bağlantı hattı olduğu yönünde, ancak bu kesinlikle kasıtlı: mimarlar tarafından araştırma grupları arasındaki iletişimi ve etkileşimi teşvik etmek için düşünülmüş bir strateji.

Şu anda lobi, sırt çantalı öğrencilerle dolu; bu öğrencilerden bazıları kıvrımlı yollardan rahat bistroya doğru ilerliyor.

Asansörün durmasını bekleyen araştırmacılar, iş istasyonlarına çıkmadan önce kısa bir sohbet ediyor.

IRB, IOR ve EOC enstitüleri için tek konum ve BIOS+ markası

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudundaki hücrelere, Renato Paro ile Basel'deki Zürih Federal Politeknik BSS binası içindeki araştırmalarda
Renato Paro, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü'nde Onursal Profesördür.
(Fotoğraf: ETH Zürih)

Renato Paro: “Bu bina olağanüstü bir yolculuğun doruğunu temsil ediyor”

Atriyumun merkezinde Renato Paro e Sven Panke.

Şimdi moleküler biyoloji alanında fahri profesör olan eski kişi, hâlâ mimari konseptten gözle görülür biçimde etkileniyor.

“BSS binasına girip tüm bu ofisleri, laboratuvarları ve ortak araştırma platformlarını gördüğümde, bölümümüzü oluşturmak için harcadığımız tüm zaman ve çabaya gerçekten değdiğini düşünüyorum”Zar.

2006 yılında yeni ortaya çıkan Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Merkezi'nin (C-BSSE) ilk yöneticisi olarak atanan Renato Paro, daha sonra ETH'de Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü'nün (D-BSSE) kurulmasındaki itici güçlerden biri oldu.

“Benim için bu mülk olağanüstü bir yolculuğun doruk noktasını temsil ediyor”, iddia ediyor.

Fotoğraf galerisi, "Belli" araştırma merkezinin açılışı

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binasında Sven Panke ile yapılan araştırmalarda
Sven Panke, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nde Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölüm Başkanıdır.
(Fotoğraf: ETH Zürih)

Sven Panke: “Her katta tematik alanlar yerine araştırma gruplarının bir karışımı”

“Tasarım aşamasından itibaren amacımız, çeşitli bileşenlerin etkileşimi ve bilimsel alışverişi teşvik ettiği bir bina yaratmaktı.“, diye devam ediyor Panke.

Bu yıl bölümün dizginlerini eline alacak ve konuşurken sık sık başını sallayacak, aynı zamanda mevcut tüm profesörlerin orijinal bir konsepte dayanan güzel bir şeyin inşasına nasıl sürekli katkıda bulunduklarının altını çizecek: "Her katın konu alanlarına göre organize edilmek yerine karma araştırma gruplarından oluşması gerektiğine karar verdik."

Video, EOC, IOR ve IRB enstitülerinin genel merkezinin "cilası"

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Tonozlu cam ve çelik kubbe, Basel yakınındaki Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü'ndeki BSS binasının geniş iç avlusuna bol miktarda doğal ışık getiriyor
(Fotoğraf: Alessandro Della Bella/ETH Zürih)

Deneysel biyoloji, teorik hesaplamalı ve biyomühendislik yakın temas halinde

Bölüm üç ana alana bölünmüştür (deneysel biyoloji, teorik hesaplamalı biyoloji ve biyomühendislik) ve binanın her katında bitişik ofislerde ve laboratuvarlarda çalışan deneysel biyologlar, biyoinformatikçiler ve biyomühendislerin bir karışımı bulunmaktadır.

"D-BSSE'nin ana avantajlarından birinin, grupları birbirleriyle iletişim kurmaya teşvik etmek için bu üç araştırma alanını tek bir çatı altında toplamak olduğunu hemen fark ettik. Artık hepimiz aynı çatı altında olduğumuza göre, bir araya gelmek ve etkileşimde bulunmak daha da kolay.", diyor Panke.

"Bu, disiplinler arası bir eylemdir ve dünyanın her yerinden araştırmacıları cezbetmektedir.".

Bellinzona'da yaşam bilimlerinde süper mükemmellik kutbu

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudundaki hücrelere, Niko Beerenwinkel ile Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Niko Beerenwinkel, Basel'deki ETH Zürih Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümünde Hesaplamalı Biyoloji Profesörüdür.
(Fotoğraf: ETH Zürih)

42 ülkeden araştırmacılar, Niko Beerenwinkel ve Tanja Stadler vakalarını

D-BSSE şu anda 42 farklı ülkeden akademisyenleri istihdam etmektedir.

Örneğin Sven Panke'nin biyoproses laboratuvarı, Niko Beerenwinkel'in liderliğindeki grupla aynı seviyede.

Her ikisi de bölümün, yaşam bilimlerindeki temel araştırmaları matematik ve bilgisayar bilimi yaklaşımıyla birleştirmeyi ve aynı zamanda teknoloji ve mühendislik bileşenini birleştirmeyi amaçlayan özel misyonunun güçlü destekçileridir.

Panke, gelişmiş hücre varyantlarını keşfetmek ve sentetik olarak kontrol etmek için kullanılabilecek biyoproses mühendisliğine yönelik minyatürleştirme teknikleri konusunda uzmandır.

Beerenwinkel ise matematik, bilgisayar bilimi ve yapay zekayı biyoloji ve tıpla birleştiriyor.

Hesaplamalı yöntemlerinin uygulamaları, viral hastalıkları moleküler düzeyde karakterize etme ve tanımlama yeteneğini içerir.

Modellerinin koronavirüs salgını sırasında çok faydalı bir araç olduğu kanıtlandı.

D-BSSE'de hesaplamalı evrim profesörü ve İsviçre COVID-19 Bilimsel Danışma Grubu başkanı Tanja Stadler ile birlikte, virüsün yeni varyantlarını belirleme ve bunların evrimini ve yayılmasını takip etme çabalarında önemli bir rol oynadı.

Lugano'da insan ve doğa bilimleri arasında yenilikçi bir kavşak

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudundaki hücrelere, Tanja Stadler ile Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Tanja Stadler, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nde Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölüm Başkan Yardımcısıdır.
(Fotoğraf: ETH Zürih)

Doğada bulunmayan özelliklere sahip hücreler, organoidler ve mikroorganizmalar

D-BSSE araştırmacılarının çalışmaları sistem biyolojisinin temellerine dayanmaktadır.

Amacı hücrelerin, organların ve organizmaların işleyişine ve onları hayatta tutan zamansal ve biyokimyasal süreçlere ilişkin bütünsel bir anlayış oluşturmaktır.

Bunu incelemek için araştırmacılar genellikle DNA sıralayıcılar gibi yüksek verimli teknolojiler tarafından üretilen büyük veri kümelerinin yanı sıra matematiksel modeller ve bilgisayar simülasyonlarını kullanır.

Sistem biyolojisi aynı zamanda D-BSSE'nin ikinci araştırma hattında da önemli bir rol oynamaktadır.

Bu sentetik biyolojidir ve asıl amacı doğada bulunmayan yeni özelliklere sahip ve birçoğu potansiyel tıbbi faydalar sunan hücreler, organoidler ve mikroorganizmalar üretmektir.

İsviçre'deki en yüksek gökdelen bir yenilik tapınağıdır

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Zürih'teki Federal Teknoloji Enstitüsü'nün Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü içindeki yeni binası: D-BSSE'nin (Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü) beşgen şeklindeki yenilikçi genel merkezi, Biozentrum'a yakındır. Pharmazentrum, DBM'nin yanı sıra Çocuk Hastanesi ve Basel Üniversite Hastanesi'nde
(Fotoğraf: Erich Meyer)

Liderler: sentetik immünoloji ve çip üzerinde laboratuvar teknolojileri için aşılar ve antikorlar

D-BSSE'nin hücreleri ve organizmaları düzenlemek için DNA'yı kullanan biyomühendislik alanındaki çalışmasının da aynı derecede pratik bir amacı var.

Bu araştırmanın somut sonuçları arasında sentetik immünolojiye yönelik aşılar ve antikorların yanı sıra metabolik bozukluklarla mücadeleye yardımcı olabilecek hücre implantları ve çip üzerinde laboratuvar teknolojileri gibi minyatür platformlar yer alıyor.

“Basel departmanımızın öncü çalışma alanlarından ikisi biyomühendislik ve hesaplamalı veri bilimidir”2009'dan bu yana Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü'nün bir parçası olan Panke, diyor.

"Öğrencilerimize bu iki bileşeni birleştirmenin faydalarını da göstermemiz mantıklı."

Video, Basel'deki Roche genel merkezinin fütüristik Tower 2'si

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Sentetik biyoloji, Basel yakınlarındaki Schällemätteli'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün yeni entegre çalışmalar bölümünün önemli bir araştırma alanıdır.
(Fotoğraf: Alessandro Della Bella/ETH Zürih)

Zürih basınının şüpheciliğine rağmen 2000 yılında bir ETH fikri filizlendi

ETH Basel'de bir biyobilim araştırma enstitüsü kurma fikri 2000 yılında filizlenmeye başladı.

Geriye dönüp bakıldığında bu vizyonun ne kadar cesur olduğu açıkça görülüyor.

ETH Zürih'in 2007 yılında D-BSSE'yi Basel'de ayrı bir departmana dönüştürme ve ona güvenli uzun vadeli finansman sağlama kararı da aynı derecede zekiceydi.

Doğal olarak Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü'nün gelişimi her zaman güllük gülistanlık olmadı: örneğin 2003 yılında Neue Zürcher Zeitung bazı makalelerinde Rheinland şehrinde bir ETH ileri karakolu oluşturma projesinin zorluklarla karşılaştığını bildirdi. .

Gazete, ETH Zürih'in Basel'de tam teşekküllü bir biyomühendislik veya biyomedikal mühendislik bölümü oluşturma planlarına duyduğu şaşkınlığı dile getirdi: "Böylesine büyük bir fikir neredeyse gerçekleştirilemez görünüyor."

Ancak gazetecilerin şüphelerinin asılsız olduğu ortaya çıktı.

İnovasyon ve yaşam bilimleri? Gelecek… Aargau'nun “küçük hazinesi”

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Zürih'teki Federal Teknoloji Enstitüsü'nün Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü içindeki yeni binası: D-BSSE'nin (Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü) beşgen şeklindeki yenilikçi genel merkezi, Biozentrum'a yakındır. Pharmazentrum, DBM'nin yanı sıra Çocuk Hastanesi ve Basel Üniversite Hastanesi'nde
(Fotoğraf: Erich Meyer)

Rosental bölgesinden mevcut Yaşam Bilimleri Kampüsü'nün BSS binasına

D-BSSE'nin gelişiminin bir sonraki aşaması, Rosental lokasyonundan Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü'ndeki BSS binasına taşınmayla gerçekleşti.

Sistem biyolojisi ve sentetik biyoloji ilgi kazandıkça ve bu alanlardaki bilgi ilerlemeye devam ettikçe, temel araştırma bulgularının tıbbi uygulamalara dönüştürülmesine artan bir vurgu yapılmaktadır.

"Günümüzde sistem biyolojisi, bir hücrenin nasıl çalıştığına dair o kadar derin bir anlayışa sahip ki, hücre içindeki önemli süreçleri kontrol etmek için gerekli bilgilerin çoğunu sağlayabilir.", diye açıklıyor Paro.

"Bu uzmanlığı kullanarak sentetik biyologlar bir hücreyi yeni bir görevi yerine getirecek şekilde yeniden programlayabilirler. Gelecekte bu yeniden programlanmış hücreler tedavi amaçlı kullanılabilir."

Sisslerfeld geliştirme merkezinden 4,2 milyar frank daha

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Basel'deki BSS Binasının 2003'teki tasarım anından 2024'teki fiili açılışına kadar doğuşu ve inşasını anlatan bir infografik
(İllüstrasyon: ETH Zürih)

İyi Üretim Uygulamaları çerçevelerinde çeviri araştırmasının başarısı

Ancak bu tür hücreler ancak en katı farmakolojik standartlara uygun olarak üretildiğinde hastalarda kullanılabilir.

Taşınmadan önce D-BSSE bu amaç için gerekli altyapıya sahip değildi ancak yeni BSS binası GMP yani İyi Üretim Uygulamaları tesisi ile donatıldı.

“Bu artık araştırmamızın çeviri aşamasına geçebileceğimiz anlamına geliyor”, diyor Paro.

"GMP koşulları altında çalışarak, yeniden programlanan hücreleri iyileştirebilir ve klinik deneylerde kullanılabilmesi için onları saflaştırabiliriz."

İtalyanca konuşulan İsviçre'de Yaşam Bilimleri sektörünün değeri ne kadar?

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Zürih'teki Federal Teknoloji Enstitüsü'nün Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü içindeki yeni binası: D-BSSE'nin (Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü) beşgen şeklindeki yenilikçi genel merkezi, Biozentrum'a yakındır. Pharmazentrum, DBM'nin yanı sıra Çocuk Hastanesi ve Basel Üniversite Hastanesi'nde
(Fotoğraf: Erich Meyer)

Basel Üniversite ve Üniversite Hastanesinin yardımıyla tıbbi tedavi

Yeni GMP veya İyi Üretim Uygulamaları yapısı, Basel Üniversitesi ve Basel Üniversite Hastanesi ile işbirliği içinde ETH Zürih tarafından yönetilmektedir.

Araştırmacılara, insanlarda yapılan klinik araştırmalara yönelik düzenleyici gereklilikleri karşılayan gen, hücre ve doku terapisi ürünleri üretmek için titizlikle kontrol edilen bir ortam sağlar.

Translasyonel araştırmaya yönelik bu evrim, D-BSSE'nin Basel Üniversite Hastanesi, Basel Üniversite Çocuk Hastanesi ve Basel Üniversitesi Biozentrum'un hemen yakınında bulunan Schällemätteli'deki Yaşam Bilimleri Kampüsü'ndeki yeni konumuyla da kolaylaştırılmıştır. .

Basel Üniversitesi Biyotıp Bölümü ve Rheinland şehrindeki Çocuk Sağlığı Araştırma Merkezi de yakınlarda yeni tesisler inşa etmeyi planlıyor.

Bu yakınlık, biyolojik araştırmaların tıbbi uygulamalara dönüştürülmesini daha da hızlandırmalıdır.

Mirandola'nın biyomedikal bölgesinin temel yeniliği

Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü Yaşam Bilimleri Kampüsü'nün BSS binası

Basel'deki ETH Zürih Biyosistem Bilimi ve Mühendisliği Bölümü hakkında her şey

Mühendislik bilgisayar biyolojisi: matematiksel teoriden insan vücudunun hücrelerine, Basel'deki Zürih Federal Teknoloji Enstitüsü'nün BSS binası içindeki araştırmalarda
Tonozlu cam ve çelik kubbe, Basel yakınlarındaki Schällemätteli Yaşam Bilimleri Kampüsü'ndeki BSS binasının geniş iç avlusuna bol miktarda doğal ışık getiriyor (Fotoğraf: Alessandro Della Bella/ETH Zürih)